From e7d95216ea73b520cf877f6b5a3955d134935da0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Manfred Touron Date: Thu, 29 Oct 2015 15:49:13 +0100 Subject: [PATCH] Update README.md --- wookie à poil dur/README.md | 22 +++++++++++++++++----- 1 file changed, 17 insertions(+), 5 deletions(-) diff --git a/wookie à poil dur/README.md b/wookie à poil dur/README.md index 48da896..6bf919e 100644 --- a/wookie à poil dur/README.md +++ b/wookie à poil dur/README.md @@ -1,6 +1,15 @@ -Le génome du wookie à poil dur vient d'être séquencé. Malheureusement, le séquenceur est une merde monumentale, conçue par nul autre que l'empereur Palpatine, qui est connu pour concevoir des merdes. Demandez à Dark Vador. Je m'égare. Le séquenceur a donc sorti des séquences absolument riquiqui et inexploitables. Heureusement, vous êtes là. Vous avez entendu parler d'une méthode hyper connue chez les bioinformaticiens : le graphe de De Bruijn. Elle consiste à découper les reads (vous savez les petits cacas que le séquenceur de Palpy prend pour des séquences) en morceaux chevauchants de taille k (k-mers dans l'intimité) et à tracer un graphe qui relie deux k-mers s'ils coïncident sur k-1 bases, comme suit : +# wookie à poil dur +**Le génome du wookie à poil dur vient d'être séquencé.** + +Malheureusement, le séquenceur est une merde monumentale, conçue par nul autre que l'empereur Palpatine, qui est connu pour concevoir des merdes. Demandez à Dark Vador. Je m'égare. Le séquenceur a donc sorti des séquences absolument riquiqui et inexploitables. Heureusement, vous êtes là. + +Vous avez entendu parler d'une méthode hyper connue chez les bioinformaticiens : le graphe de De Bruijn. +Elle consiste à découper les reads (vous savez les petits cacas que le séquenceur de Palpy prend pour des séquences) en morceaux chevauchants de taille k (k-mers dans l'intimité) et à tracer un graphe qui relie deux k-mers s'ils coïncident sur k-1 bases, comme suit : + +``` ATTGC-TTGCT-TGCTA-GCTAG (qui donnera à la fin ATTGCTAG) +``` et ainsi de suite. Vous voyez le topo. Ensuite, il faut reconstituer la séquence en parcourant le graphe, comme une fleur (ou un jedi, c selon vos goûts). @@ -57,12 +66,15 @@ Votre mission, si vous l'acceptez, est donc de faire triompher le côté clair d TTGACTTTAGAGCAGAGGAGAGTAG TTGTATTTCATTTGATTTTCCCCCGCCCCTCCC -Que la force soit avec vous ! +**Que la force soit avec vous !** + +--- -Les gagnants du challenge, dans l'ordre : +## Winners -zigazou -moul +Les gagnants du challenge de rapidité, dans l'ordre : +1. zigazou +2. moul Anakin Skywalker (hors concours)